一般大额存单最低起存金额为20万元，甚至有部分银行为30万元、50万元起存，这一高门槛就将很多投资者拒之门外。而且大额存单是按期发行的，每期发行的额度有限，这可能会导致储户买不上。
大额存单具有一定的期限，一般分为1个月、3个月、6个月、9个月、1年、18个月、2年、3年和5年这几种品种，如果用户提前支取，则会按支取日活期存款利率计息。因为本金高，所以提前支取损失的利息是非常大的，不太适合短期闲置资金理财。
虽说可转让大额存单可以在二级市场卖出收回资金，不像提前提前支取那样损失利息，但在通常情况下，让出方必须让利才能交易成功，就会导致大额存单的实际利率并没有那么高。如果遇到市场流动性不足的时候，让利的幅度会更大，甚至可能出现低于同样存期定期存款利率的情况。
虽然大额存单与银行的活期存款、定期存款相比较，其利率要高一些，但是与同类理财产品相比要低，流失的机会成本也更多，对于追求高收益的投资者来说不怎么划算。
根据存款保险条例，如果我国银行如果倒闭了，最高可以获得50万的赔偿。所以像有的投资者存了一百万的大额存单，只有50万本金是线万，虽然本金安全，但利息没有保障。
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